Альфа-канал (alpha channel) — это значение, точно такое же, как цветовые компоненты (красный, зеленый и синий). Оно определяет степень прозрачности для каждого пикселя изображения.
Однако, OpenCV пока не умеет работать с 4-канальными изображениями RGBA (как ни трудно догадаться A — это и есть обозначение альфа-канала). При загрузке RGBA изображения оно просто преобразуется в RGB.